第1集剧情
皇宫大内，夜色沉静，在这一派静谧的气氛中，皇宫一角却正酝酿着浓重的杀机。宫室里的人似有所觉，正在翻箱倒柜的寻找着重要的东西，然而只来得及把桌上的《青囊经》装好，蒙面杀手就杀到了门口。
作为一个低级的宫女，英慧一向老实本分与世无争，她来到父母的住处门口，却正看到屋里发生的血案。已经身中一刀的母亲抱住杀手的腿，父亲把装着《青囊经》的包袱塞给英慧，在她面前把门关上，努力用自己的身体堵住出去的道路，拖延杀手的行动。英慧突逢变故呆愣当场，看到门上透出的两柄带血的钢刀终于回魂，流着眼泪回身逃跑。
神针堂的善珍师傅刚刚给皇子彻夜看病陪护，如今皇子的病情稍稳，他才疲倦的一边在车上打盹，一边返回神针堂。
他的徒弟皇甫谧看到师傅睡着也不打扰，中间停车找地方方便，却不知道英慧趁此机会悄悄藏进了车上装运
皇甫谧回到车旁准备上车出发，迎面却来了一队官兵，追问他们有没有看到一个宫女。善珍师傅被官兵吵醒，直言自己和徒弟彻夜未眠，如今刚从皇宫出来。官兵听说车上是御赐的赏赐，断然不敢私自翻看，恭敬地放走了他们。
太尉
到了神针堂，善珍师傅先要休息，满堂的弟子却对随车运回来的两只大箱子很是好奇，怂恿陪着师傅一起进宫的皇甫谧打开箱子让大家见识一下御赐的宝贝。皇甫谧果然如大家所愿打开了箱子，却没想到箱子里是个女子。
皇甫神医剧照
大家以为这女子就是皇上的赏赐很是吃惊，皇甫谧推醒箱子里的姑娘，看她一身脏衣狼狈不堪很是奇怪，询问姑娘到底是什么人。这姑娘正是死里逃生的英慧，她乍然醒来看到一屋的男子很是心慌，顾不上搭话夺路而逃，皇甫谧只好紧随其后，谁知追到院子里，姑娘就藏了起来，不见踪迹。
城外的山里，几个采药人正在各凭眼力从众多植物中分辨着可用的药材，突然一阵惨叫，原来正在采药的一男一女都无意中摸到和踩到了捕兽夹，二人伤口鲜血琳琳很是吓人。其余的采药人都关切的围上去查看他们的伤势。
见到自己安排的陷阱奏效，隔壁村里的恶霸梁家公子很是得意的带着一帮打手现了身。原来这满地遍布的捕兽夹正是他们使得坏。梁公子出言威胁，要求药农们必须把采到的好药优先供应给自家的草春堂。药农们见他仗势欺人还要低价收药都很是气愤，不肯向他低头，梁公子就命令手下出手，准备教训一下这些采药人。
也在附近采药的香苓听到了这边的动静赶了过来，武功高强的她出手相助，把梁公子和他的手下都打得落荒而逃，香苓在乡亲们的感谢声里笑着离开回了家。香苓把自己出手惩治恶霸的事情得意的告诉父母，同为药农的父亲老桂皮却很是担心，觉得香苓一个女孩子却总是舞拳弄棒的不太合适。香苓自有主意，也不理会父母的担心，跑进房里去了。
善珍师傅休息好了，召集弟子们讲解医术，皇甫谧觉得师傅总是藏私，不肯把绝学一针贯三穴教给大家，言辞中多有不满。善珍师傅却批评皇甫谧好高骛远，希望他能踏踏实实学好基础。如今面对皇子的病情，善珍师傅也觉得很是棘手，如果有华佗所著的《青囊经》在手，治病就多了些把握。皇甫谧并没把师傅的话听进去，看出他不以为然的样子，师傅又宣布了一个惊人的消息，皇上见善珍师傅调养皇子的病情颇有起色很是高兴，准备赐给他一个老婆。师傅不敢拒绝皇上的好意，又怕皇上胡乱指婚，索性假托自己与药农之女香苓交好，结果皇上赐婚，让善珍师傅与香苓结为夫妇。
皇甫谧听到消息最是激动，香苓一直跟随善珍师傅学医，与神针堂众弟子从小一起长大，既是师姐也是手足，更是皇甫谧一直以来心仪之人，听到消息皇甫谧很难接受，急忙跑去找香苓。
李公公拿着圣旨来传旨给香苓，下令让她嫁给善珍师傅为妻。香苓很是吃惊，但是圣旨当前，只能硬着头皮接了旨意。看着香苓叩谢皇恩，走到香苓家门口的皇甫谧知道一切不可逆转，伤心的回到了神针堂。
梁柳没能如愿娶到香苓很是不甘心，回到家里，司马魁和梁父正在聊天。梁父指责儿子不该没娶正室就惦记着卑贱的药农之女，梁柳却告诉父亲，自己娶香苓是为了把附近药农们的主心骨捏在手中，好控制以后药农们的药材供应。司马魁对梁柳的心计很是欣赏，向他透露宫里的宫女携《青囊经》出逃的事情，让他一起帮忙参详这宫女可能去的地方。梁柳觉得，《青囊经》是既能救人也能害人的医书，但是落在普通人手中一文不值，只有落在他们草春堂或者神针堂中人手中才能起作用。
皇甫谧在厨房发现了高烧不退躲在这里的英慧，可怜她病弱还要被人追杀，答应让她藏在神针堂里容身，还让大师兄帮她拿药治病。
香苓接到圣旨很是疑惑，只能赶来神针堂找师傅问个明白，却在神针堂后院看到了鬼鬼祟祟的梁柳，香苓和梁柳动起手来，神针堂的弟子一起赶走了不怀好意的梁柳。
英慧的病情稍轻，看到外面的动静如惊弓之鸟，急忙偷偷溜了出来。梁柳发现神针堂里有陌生的女子，让自己的手下高升跟着英慧，看看她到底是什么人。英慧一路逃亡，对跟踪之人很是敏感，找机会甩掉了高升，消失在茫茫人海中。
善珍师傅知道香苓来了，让她随自己到房间谈话。善珍师傅知道皇上已经颁下圣旨赐婚，给了香苓一个锦囊，权作订婚之物。香苓打开一看，里面有支金钗，还有一封写好的休书。原来善珍师傅因为医术高超常在宫里给诊病，早就被很多朝臣视为威胁，皇上当日赐婚善珍师傅不敢回绝，害怕触怒皇上。但是他也不忍心香苓身为弟子，年轻貌美就嫁给自己这半百老人，还是决定去找皇上谢绝这门亲事。香苓也知道伴君如伴虎，如果师傅抗旨，再被有心人特意夸大其词联想一番，别说师傅性命不保，就是神针堂是否能够延续都成了问题。思前想后，香苓告诉众人，自己能有幸伺候师傅是三生有幸，答应了嫁给善珍师傅。香苓看着难过的皇甫谧，忍痛告诉他，希望他们明天就用八抬大轿把自己接到神针堂与师傅完婚。
香苓知道梁柳不会就这样放过自己，她请龙虎山山寨大王
第二天神针堂里喜气洋洋办起了亲事，善珍师傅治病救人，很多乡邻都来道贺。布准和神针堂也有交情，带了山寨的弟兄来贺喜。
梁柳不甘心香苓就这样逃出自己的手心，他和高升拦住正在四处搜捕宫女的官差，声称在神针堂里见过陌生可疑的女子，引官兵前去搜查。
皇甫谧正和布准说话，看到院子里来了官兵，赶忙让他们先避一避。
